Структуру органов местного самоуправления Сегежского муниципального района составляют:
- Совет Сегежского муниципального района - представительный орган Сегежского муниципального района;
- глава Сегежского муниципального района;
- администрация Сегежского муниципального района - исполнительно-распорядительный орган Сегежского муниципального района;
- контрольно-счетный комитет Сегежского муниципального района - контрольно-счетный орган Сегежского муниципального района;
Органы местного самоуправления сельских поселений Сегежского муниципального района:
Структуру органов местного самоуправления муниципального образования «Валдайское сельское поселение» составляют:
- Совет Валдайского сельского поселения - представительный орган Валдайского сельского поселения;
- глава Валдайского сельского поселения:
- администрация Валдайского сельского поселения;
- ревизионная комиссия Валдайского сельского поселения.
Структуру органов местного самоуправления муниципального образования «Идельское сельское поселение» составляют:
- Совет Идельского сельского поселения;
- глава Идельского сельского поселения;
- администрация Идельского сельского поселения;
- контрольно-счетный орган Идельского сельского поселения (далее контрольно-счетный орган).
Структуру органов местного самоуправления муниципального образования «Поповпорожское сельское поселение» составляют:
- Совет Поповпорожского сельского поселения - представительный орган Поповпорожского сельского поселения;
- глава Поповпорожского сельского поселения;
- администрация Поповпорожского сельского поселения;
- ревизионная комиссия Поповпорожского сельского поселения.
Структуру органов местного самоуправления муниципального образования «Чернопорожское сельское поселение» составляют:
- Совет Чернопорожского сельского поселения;
- глава Чернопорожского сельского поселения;
- администрация Чернопорожского сельского поселения;
- ревизионная комиссия Чернопорожского сельского поселения.